独自開発のDNAマイクロアレイシステムによるヒト組織やがん細胞株の網羅的遺伝子発現解析データを提供いたします。
●約14,000遺伝子の発現データが揃っています。
●遺伝子発現レベルの分布が一目で分かります。
●一括または遺伝子単位での提供となります。
ラインナップ
F-ExpTissues: ヒト組織 10,520サンプル
F-ExpMacaque: カニクイザル正常組織 825サンプル
F-ExpCells: 細胞株 1,022種類
F-ExpPDX: 患者由来凍結腫瘍組織 (F-PDX) 274系統
F-ExpPDO: がんオルガノイド (F-PDO) 62系統
F-ExpRat: ラット正常組織 89サンプル(4系統由来)
ヒト組織の遺伝子発現データ(F-ExpTissues)
約1万サンプルにおける遺伝子発現レベルを横並びで比較できます。
【活用例】
✓ 創薬(特に抗体医薬)の可能性の評価に
✓ 治療ターゲットの探索に
✓ 薬効および副作用の予測に
✓ 疾患マーカー・患者層別化マーカーの探索に
【全データのヒートマップとサンプルの内訳】

【遺伝子単位のデータ例】 承認薬と開発中止となった分子標的薬の標的分子の遺伝子発現レベル









■ 関連資料
| タイトル | 形式 |
| リーフレット |
カニクイザル遺伝子発現データ(F-ExpMacaque)
- カニクイザルから採取可能なあらゆる組織(正常)を採取しました。
- 採取した正常組織より抽出したRNAを用いて遺伝子発現プロファイルを取得し、データベース化しました。
- カニクイザルとヒトの遺伝子配列は非常によく似ているため、ヒト用のDNAマイクロアレイを用いてカニクイザルの遺伝子発現プロファイルを取得することが可能です。取得した遺伝子発現プロファイルは、ヒト由来サンプルの遺伝子発現プロファイルとの横並び比較が可能です。
- カニクイザルは、ヒトでは入手が難しい正常な臓器や組織を採取できるため、正常組織における薬剤(特にバイオ医薬品)の標的分子の発現状況を詳細に検討することが可能です。副作用を予測するうえで有用です。
- ヒトとカニクイザルの遺伝子発現プロファイルの相違点を明らかにすることにより、ヒト特有の生物学的特性の理解に役立ちます。

カニクイザルはヒトの代替モデルとしての価値を高めており、創薬研究に欠かせない重要なリソースとなりつつあります。創薬研究または生物学の新たなステージへの礎として、ぜひカニクイザルの遺伝子発現データをご活用ください。
カニクイザル組織
・2種類のデータセットをご用意しております。
・全データセットの一括提供も可能です。
全取得数:825


■ 利用可能なカニクイザル組織サンプルのリスト
| タイトル | 形式 |
| カニクイザル組織サンプルリスト | Excel |
■ 関連資料
| タイトル | 形式 |
| リーフレット |
がん細胞株の遺伝子発現データ(F-ExpCells)
約1,000種類のがん細胞株における遺伝子発現レベルを横並びで比較できます。
【活用例】
✓ 研究で使用する細胞株の選定に
✓ 研究で使用している細胞株のバリデーションに
✓ 特定の遺伝子の発現分布の確認に
✓ 薬剤感受性との相関解析に
【全データのヒートマップとサンプルの内訳】

【遺伝子単位のデータ例】


【全データを用いたクラスタ分析】

■ 関連資料
| タイトル | 形式 |
| リーフレット |
ラット遺伝子発現データ(F-ExpRat)
4系統ラットの網羅的な遺伝子発現を参照できるデータセット
特徴
11,500遺伝子、最大23臓器の網羅的遺伝子発現プロファイル
● DNAマイクロアレイを用いて、多臓器の遺伝子発現を横並びで比較
4系統の無処置個体を使用したベースラインデータ
● 4系統の無処置個体を使用
● 各系統1個体(n=1)のみを解析
● 探索的解析・仮説生成に利用
活用イメージ
系統間・疾患モデル間の比較
免疫不全モデルと通常系統の比較
特徴的な遺伝子の探索
高血圧モデルの遺伝子発現傾向の把握
標準値の参照データとして利用
候補遺伝子やシグナル経路の抽出などに利用
サンプルサイズ(n=1)の特性上、統計的検定はしておりません。確定的な結論を導くためではなく、研究の初期段階におけるクラスタリングや把握傾向、および次世代解析へのアジャイルな仮説生成ツールとしてご活用ください。
サンプル詳細

採取臓器

解析例: 全サンプルを横並びで比較
遺伝子発現比をヒートマップで示したものです。赤色は全臓器由来の混合RNA(リファレンス)と比較して発現が高いこと、青色は低いことを示します。全サンプルを横並びで表示することで、臓器ごとに特徴的な遺伝子発現パターンを確認できます。さらに、一部の臓器では4系統間で発現パターンが異なることも確認できます。

解析例: 遺伝子単位のデータ例(X-SCIDラットで特徴的な遺伝子)
原因遺伝子であるIl2rgに加え、他の特徴的な遺伝子についても、23臓器における発現パターンを一覧で確認できます。ヒートマップと発現量グラフを組み合わせることで、各遺伝子の臓器ごとの特徴を視覚的に把握できます。

解析例: 遺伝子単位のデータ例(SHRラットで特徴的な遺伝子)
高血圧との関連が報告されているThに加え、他の特徴的な遺伝子についても、23臓器における発現パターンを一覧で確認できます。ヒートマップと発現量グラフを組み合わせることで、各遺伝子の臓器ごとの特徴を視覚的に把握できます。

4系統ラット遺伝子発現データセットおよびRNAの提供

■ 関連資料
| タイトル | 形式 |
| リーフレット |
遺伝子発現データの解析を容易に行える「F-Exprofiler®」も提供しております。
是非併せてご利用ください。
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